上海建工科技创新研发平台建设始于1999年， 2001年通过国家级企业技术中心认定。截至2019年，集团已形成1个国家企业技术中心为核心，1个上海市院士专家服务中心、2个博士后工作站、2个上海创新战略联盟、12个上海工程技术研究中心、12个市级企业技术中心和22个国家高新技术企业为支撑，各有偏重、优势互补的两级研发体系和多元化平台。
为进一步突破集团科技创新工作中存在的瓶颈，集团在2019年6月根据集团中恒久科技生长规划要求，组建了集团工程研究总院。集团工程研究总院按两级研发机构进行建设，一级研发机构包罗咨询机构、综合机构、研发机构、产业化机构；二级研发机构包罗集团下属子企业工程研究院或 研究院。两级研发机构发挥各自所长，形成了优势互补的协同生长格局。